Hiện quỹ đã được chia thành nhiều cụm chuyên môn: cấp giao thức, cấp truy cập, cấp người dùng, cộng đồng và khối thể chế, cùng với cụm vận hành và đội ngũ quản lý.
Cụm giao thức chịu trách nhiệm về việc mở rộng quy mô và bảo vệ Ethereum khỏi kiểm duyệt cũng như sự chiếm đoạt, bao gồm phát triển các biện pháp bảo vệ hậu lượng tử, zkEVM và quyền riêng tư trên L1. Cụm truy cập đảm bảo khả năng tương tác với mạng mà không cần trung gian thông qua các giao diện xác thực, giao dịch riêng tư và quản lý tài sản tự chủ. Cụm người dùng thu thập phản hồi từ người dùng thực tế để cải thiện các giải pháp giao thức. Cụm cộng đồng điều phối các hoạt động truyền thông bên ngoài và định vị EF. Khối thể chế giám sát mối quan hệ với các tổ chức tài chính, cơ quan nhà nước và cộng đồng học thuật.
Những nhân viên bị sa thải sẽ nhận được trợ cấp thôi việc bằng tiền lương một tháng cho mỗi năm làm việc tại quỹ, cũng như khoản tài trợ chuyển tiếp dành cho coaching nghề nghiệp và tìm kiếm việc làm trong nội bộ hệ sinh thái.